2000年，我院被審定為首批城鎮職工基本醫療保險定點醫療機構。為保證自治區、呼市醫保各項政策的落實與實施，更好的為參保人員服務，2001年2月，醫院在原公費醫療管理科的基礎上成立了部門前身社會醫療保險部。2023年5月，為適應醫院醫保工作的實際需要，正式更名為醫療保障部。

　　醫療保障部下轄職工醫保結算窗口、居民醫保結算窗口、慢病窗口、質控組和會計組五個小組，主要負責我院住院患者的醫保結算、外傷審核、門診慢病審核等基本醫療保障相關的工作。

　　為嚴格執行《內蒙古自治區城鎮基本醫療保險條例》《內蒙古自治區醫療服務項目規范與價格》《內蒙古自治區可單獨收費醫用耗材目錄》等法律法規，醫療保障部定期對臨床科室進行檢查。同時，定期組織全院醫務人員學習醫療保險政策及相關規定。督促各科室依法依規開展診療活動。

　　附屬醫院醫療保障部長期致力于服務水平的提升，是呼市地區首家編制了內蒙、呼市兩級醫療保險參?；颊咦≡横t療費用核算程序及門診和住院劃卡網絡的醫療機構，現已實現基本醫療保險出院直報功能。

　　目前，我院已成為呼和浩特地區規模最大，就醫參保人數最多，組織機構健全，規章制度完善，管理規范的大型定點醫療機構。