內蒙古醫科大學附屬醫院康復治療中心位于門診綜合樓7樓西側，環境整潔舒適，是患者首選的康復治療中心。中心成立于2009年，擁有自治區較先進康復理念及國內外先進的康復設備，而且工作人員近幾年均接受過香港、北京及廣州等地的先進理念及技術培訓。目前中心分為物理運動治療室、作業及職業治療室、傳統治療室、言語認知治療室、物理因子治療室、評定室及矯形輔具治療室等。目前以骨關節疾患及運動損傷功能障礙康復與神經疾患所致身體運動功能、語言吞咽功能和心理認知功能障礙的康復為主兼顧外科術后康復、心肺康復、產后康復、淋巴水腫康復、顳頜關節紊亂康復、臟腑康復等綜合性康復治療。工作宗旨：面對全院患者的功能障礙進行評定、治療和訓練，采取各種非藥物非手術的治療措施幫助患者改善病、傷、殘的生理和心理功能，從而提高患者的日常生活能力和工作能力，使其早日回歸家庭和社會。目前共有康復治療師7人，其中碩士2人；本科5人。中心以"團隊協作、謙誠創新"作為科訓，本著以患者為中心的服務理念造福于廣大康復患者。
　　我院康復治療中心擁有美國等速肌力測試訓練系統、多功能平衡評估訓練系統、懸吊訓練系統、情景互動訓練系統、脈沖整脊治療儀、吞咽治療儀、減重步行訓練儀、智能主被動訓練器、低頻脈沖磁療儀、智能手訓練機器人、頸腰椎牽引床、電療工作站、超短波治療儀、微波治療儀等國內外先進的儀器設備，可配合治療師為患者帶來更好的治療效果。